COCAFCAL ofrece a sus clients la major calidad de café posible debajo de las normas internacionales de certificaciones.  Despues de empezar el proceso con OCIA y de vender el primer contenedor completamente organico a Elan Organic Coffee de California en 2005, la cooperativa empezó de buscar otras opciones para certificación sostenible.

Actualmente, la cooperativa mantiene las siguientes certificaciones:

Café Organico – Certificado por Biolatina desde 2006

Comercio Justo – De acuerdo a las regulaciones de FLO desde 2006

Ranforest Alliance – Garantizando mejoramiento en procesos de agricultura sostenible, protegiendo el medio ambiente, vida silvestre, derechos de trabajadores, y las comunidades desde 2006.